部分疫苗能够让人终生免疫，但为何新冠疫苗的防护力却会随时间下降？《华尔街日报》引述专家说法指出，这是因为新冠疫苗并非采用复制病毒（replicating viruses）模式，加上新冠病毒不断变异，还会在上、下呼吸道复制的关系。伦敦帝国理工学院也透露，下一代疫苗除了应对新变异株，也会加强肺部与鼻孔的免疫力。

报导指出，最有效的疫苗都使用复制病毒引发终生免疫，例如麻疹与水痘疫苗；非复制型、以蛋白质为基础的疫苗，防护力无法持续那么久，但能透过佐剂加强效力，例如破伤风与甲型肝炎疫苗。

在新冠疫苗方面，AZ与娇生属于非复制型、腺病毒载体疫苗，并且没有佐剂；辉瑞与莫德纳属于mRNA疫苗，免疫原理不同，但完全不包含任何病毒。

若是病毒和细菌突变，绕过人体免疫反应，就更难控制了。麻疹、腮腺炎、水痘几乎没有突变，但新冠病毒目前已发现至少8种变异株。俄勒冈医科大学（OHSU）教授斯利夫卡（Mark Slifka）坦言，“这确实让疫苗研究变得更复杂了”，他以流感为例，研究者每年都必须调整、推出最新款疫苗，对抗不断出现的变种。

此外，新冠病毒在上、下呼吸道都能复制。斯利夫卡指出，“我们肺部及身体的血液循环很好，但鼻孔内侧表面的血液循环不好。我们能够预防重症，是因为下呼吸道有抗体”，但上呼吸道出现少量感染的风险持续存在。